En la gran final del Torneo Clausura 2001, CD Águila logró imponerse a CD FAS tras el marcador global de 3-2, ambos partidos disputados en el estadio Jorge «Mágico» González.
Para el partido de ida, FAS «fungió» como local, el encuentro disputado el 24 de junio de 2001, finalizó empatado 1-1 con los goles de Mauro Nunes para los migueleños al minuto 45 y Gerardo Burgos puso el 1-1 definitivo al minuto 74.
En el compromiso de vuelta se jugó el 30 de junio de 2001 nuevamente en el «Mágico».
Mauro Nunes volvió a adelantar a los «emplumados» sobre minuto 43. Alejandro De la Cruz Bentos puso el 1-1 al minuto 51.
Finalmente, con un golazo de larga distancia, Roberto Martínez selló el título para Águila al minuto 69.
13º Título en la historia para Águila
El campeonato del Clausura 2001 significó el título 13 en la historia para el conjunto de San Miguel.
Para ese momento, los «emplumados» eran el máximo ganador de torneos en la historia del fútbol nacional.
En dicha final, CD FAS llegaba con 11 trofeos y CD Águila 12.
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